無土栽培和土壤栽培都是根據作物的生長發育所必需的環境條件，提供給作物充足的養分、水分、適宜的根際溫度、供氧狀況、溶液濃度及酸堿度等，通過人為栽培來獲得人們所必需的產品。
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1、兩者在各自的栽培方式及養分的供應等方面均存在很大的差異。土壤栽培的作物根系生活在具有良好的緩沖作用的土層之中，這土層充滿著水溶液和空氣。
2、作物需要的水分和養分可通過根系縱土壤中吸取。土壤不僅能支持植物，提供根系生長的環境，同時還不斷地提供營養、水分和氧氣給作物根系吸收。保持在土壤孔隙中的水分和溶解的鹽分等構成土壤溶液，作物根系主要是從土壤溶液中吸收養分。
3、土壤中存在的養分包括有機的和無機的兩大類，都必須通過微生物等作用分解成簡單可溶的化合物，溶于土壤水才能被作物吸收利用。土壤養分的主要來源靠施肥予于補充。
4、施肥主要是以氮、磷、鉀三要素。土壤空氣狀況，微生物活動，土壤酸堿度等對作物根系養分的供應起著重要作用。施入土壤中的肥料由于土壤對肥料的固定以及肥料的分解、揮發以及隨著灌溉水、雨水的徑流、下滲等的流失，因而肥料的利用率較低。
5、無土栽培的作物根系是生長在人工配制的營養液或固體基質中，它們的緩沖性能較差。因此，易受到外界條件的影響，如酸堿度、濃度、養分之間的平衡等的影響，調控與管理需較高的技術。
6、由于無土栽培使用的營養液，均是采用可溶性的無機鹽配成的，更易于被作物所吸取。能及時而有效地滿足作物生長對營養的需要，更能夠促使作物生長迅速及產量的提高，而且肥料的利用率也較高。
7、無土栽培的肥料利用率可達90－95％以上。無土栽培的產品也比土壤栽培的高出一倍以上。無土栽培不存在著象土壤栽培那樣的水分滲漏、土徑流等問題。因此，其水分的利用率遠高于土壤，一般無土栽培的水分消耗只有土壤的1/10－1/5。